{"id":8995,"date":"2026-05-25T11:37:43","date_gmt":"2026-05-25T09:37:43","guid":{"rendered":"https:\/\/www.kode-solutions.net\/?page_id=8995"},"modified":"2026-06-03T11:50:17","modified_gmt":"2026-06-03T09:50:17","slug":"similarity-search","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/www.kode-solutions.net\/it\/prodotti-e-framework-di-ai\/similarity-search\/","title":{"rendered":"Similarity Search"},"content":{"rendered":"\r\n\t
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\"\"<\/img><\/figure>\n<\/body><\/html><\/div>\n\n\n\n
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Similarity Search<\/strong><\/h1>\n\n\n\n
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Da una molecola<\/strong><\/p>\n\n\n\n

ad una mappa decisionale.<\/strong><\/p>\n\n\n\n

<\/p>\n\n\n\n

<\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n<\/div><\/div>\n\n\n\n

Identifichiamo i target biologici plausibili per le tue small molecules, mappiamo le evidenze disponibili e distinguiamo i segnali solidi dalle ipotesi esplorative. Questa soluzione \u00e8 pensata specificamente per i dipartimenti Ricerca e Sviluppo dei settori Pharma e Biotech, Nutraceutica e Cosmetica, per Contract Research Organization (CRO) e per i servizi BC, Licensing & QA.<\/p>\n<\/div>\n<\/div>\n\n\t\t\t\t\t<\/div>\r\n\t<\/div>\r\n\r\n\t\n\n\r\n\t

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\"\"<\/img><\/figure>\n<\/body><\/html>\n\t\t\t\t\t<\/div>\r\n\t<\/div>\r\n\r\n\t\n\n\r\n\t
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IL PROBLEMA<\/strong><\/strong><\/strong><\/h2>\n<\/body><\/html>\n\n\n
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Tante ipotesi, dati frammentati<\/strong><\/strong><\/p>\n<\/div>\n<\/div>\n\n\n\n

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\n

Nelle fasi iniziali di discovery ci sono molte ipotesi e<\/p>\n\n\n\n

pochi dati ordinati. Separare evidenze solide dal<\/p>\n\n\n\n

rumore richiede tempo e competenze che non<\/p>\n\n\n\n

sempre sono disponibili in-house.<\/p>\n<\/div>\n<\/div>\n\n\n

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\n\t\t\t\t\t\t\t\t<\/span> \n\t\t\t<\/h3> \n\t\t\t\t\t\t
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CLAIM FRAGILI O NON DIFENDIBILI<\/u><\/p>\n

Dossier, pitch, grant. Ogni claim richiede evidenze documentate. Senza una mappa strutturata si finisce per sovrastimare il potenziale di una molecola \u2014 o per sottostimarlo.<\/p>\n\t\t\t<\/div> \n\t\t\t\t\t\t\t

\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div> \n\t\t\t \n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div> \n\t\t \n\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div> \n \n \n\t<\/div>\n\n\n\n
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\n\t\t\t\t\t\t\t\t<\/span> \n\t\t\t<\/h3> \n\t\t\t\t\t\t
\n\t\t\t\t

TROPPO RUMORE NEI DATI DISPONIBILI<\/u><\/p>\n

ChEMBL, PubChem, GuideToPharmacology o altri DB pubblici, sono fonti ricche ma frammentate e disomogenee. Trovare il segnale vero richiede metodologia, non solo accesso ai dati.<\/p>\n\t\t\t<\/div> \n\t\t\t\t\t\t\t

\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div> \n\t\t\t \n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div> \n\t\t \n\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div> \n \n \n\t<\/div>\n\n\n\n
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<\/div> \n\t\t\t\"\"<\/img> \n\t\t \n\t\t
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\n\t\t\t\t\t\t\t\t<\/span> \n\t\t\t<\/h3> \n\t\t\t\t\t\t
\n\t\t\t\t

BUDGET SPERIMENTALE ALLOCATO MALE<\/u><\/p>\n

Senza un razionale biologico solido, i pannelli sperimentali diventano larghi e poco informativi. Si testa su target senza supporto e si brucia capacit\u00e0 su assay che non rispondono alla domanda giusta.<\/p>\n\t\t\t<\/div> \n\t\t\t\t\t\t\t

\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div> \n\t\t\t \n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div> \n\t\t \n\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div> \n \n \n\t<\/div>\n<\/div>\n<\/body><\/html>\n\t\t\t\t\t<\/div>\r\n\t<\/div>\r\n\r\n\t\n\n\r\n\t
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LA SOLUZIONE<\/strong><\/strong><\/strong><\/h2>\n<\/body><\/html>\n\n\n
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Similarity-Based Target Intelligence<\/strong><\/strong><\/strong><\/p>\n<\/div>\n<\/div>\n\n\n\n

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Un servizio consulenziale che esplora il vicinato<\/p>\n\n\n\n

chimico-farmacologico delle tue molecole, identifica i target<\/p>\n\n\n\n

biologici plausibili, mappa le evidenze disponibili e classifica ogni<\/p>\n\n\n\n

claim su una scala da “evidenza diretta” a “ipotesi esplorativa”,<\/p>\n\n\n\n

producendo output per decisioni scientifiche, industriali e<\/p>\n\n\n\n

strategiche.<\/p>\n<\/div>\n<\/div>\n\n\n\t\t

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\r\n\t\t\t\t
\u201c<\/span>

Molecole strutturalmente simili tendono a condividere profili biologici o farmacologici. \u00c8 un principio consolidato, ma anche uno dei pi\u00f9 abusati quando applicato senza controllo metodologico.<\/p>\u201d<\/span><\/div>\r\n\t\t\t\t

Alessio Sommovigo – Chemoinformatics BU Manager<\/div>\r\n\t\t\t<\/div>\r\n\t\t<\/div>\r\n\r\n\t\n\t\t\t\t\t<\/div>\r\n\t<\/div>\r\n\r\n\t\n\n\r\n\t
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Features Principali<\/h2>\n<\/body><\/html>\n\n\n

Ogni componente risponde a una domanda precisa nel processo di analisi. La pipeline \u00e8 multi-metrica, auditabile e gi\u00e0 validata su progetti cliente reali.<\/p>\n\n\n\t\t

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\r\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\r\n\t\t\t\t\t\r\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t
\r\n\t\t\t\t\t\t\t\t\"Target\r\n\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\r\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t
\r\n\t\t\t\t\t\t\t

Target Inference<\/h3>\r\n\t\t\t\t\t\t\t

Identifica e classifica i target biologici pi\u00f9 rilevanti a partire da una molecola seed o un set di molecole, con livello di evidenza esplicitato per ciascuno.<\/p>\t\t\t\t\t\t<\/div>\r\n\t\t\t\t\t<\/a>\r\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\r\n\t\t\t\t\t\r\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t

\r\n\t\t\t\t\t\t\t\t\"Chemical\r\n\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\r\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t
\r\n\t\t\t\t\t\t\t

Chemical Neighbourhood Mapping<\/h3>\r\n\t\t\t\t\t\t\t

Mappa il vicinato chimico-farmacologico: quali molecole sono simili alla seed, quanto, e quali target condividono. Da qui inferiamo plausibilit\u00e0 biologica.<\/p>\t\t\t\t\t\t<\/div>\r\n\t\t\t\t\t<\/a>\r\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\r\n\t\t\t\t\t\r\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t

\r\n\t\t\t\t\t\t\t\t\"Multimetric\r\n\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\r\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t
\r\n\t\t\t\t\t\t\t

Multimetric Similarity Scoring<\/h3>\r\n\t\t\t\t\t\t\t

Sei metriche di similarit\u00e0 (MACCS + Morgan, con Tanimoto, Dice e Cosine) aggregate in un consensus ranking. Niente fragilit\u00e0 da approccio mono-fingerprint.<\/p>\t\t\t\t\t\t<\/div>\r\n\t\t\t\t\t<\/a>\r\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\r\n\t\t\t\t\t\r\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t

\r\n\t\t\t\t\t\t\t\t\"Evidence\r\n\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\r\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t
\r\n\t\t\t\t\t\t\t

Evidence Mapping<\/h3>\r\n\t\t\t\t\t\t\t

A ogni target associamo le evidenze disponibili: attivit\u00e0 sperimentali, assay, meccanismi annotati, valori quantitativi (Ki, IC50, EC50, pChEMBL) e fonti. <\/p>\t\t\t\t\t\t<\/div>\r\n\t\t\t\t\t<\/a>\r\n\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\r\n\t\t<\/div>\r\n\r\n\t\n\n\t\t

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\r\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\r\n\t\t\t\t\t\r\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t
\r\n\t\t\t\t\t\t\t\t\"Receptor\/Target\r\n\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\r\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t
\r\n\t\t\t\t\t\t\t

Receptor\/Target Panel Verification<\/h3>\r\n\t\t\t\t\t\t\t

Fornisci una lista di target, recettori o pathway di interesse: verifichiamo se per ciascuno esistono segnali interni, indiretti, deboli o assenti.<\/p>\t\t\t\t\t\t<\/div>\r\n\t\t\t\t\t<\/a>\r\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\r\n\t\t\t\t\t\r\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t

\r\n\t\t\t\t\t\t\t\t\"External\r\n\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\r\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t
\r\n\t\t\t\t\t\t\t

External Corroboratio<\/h3>\r\n\t\t\t\t\t\t\t

Cinque database farmacologici esterni (ChEMBL, PubChem, GuideToPharmacology, BindingDB, DrugCentral) per rafforzare, contestualizzare o declassare le ipotesi emergenti dal vicinato chimico.<\/p>\t\t\t\t\t\t<\/div>\r\n\t\t\t\t\t<\/a>\r\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\r\n\t\t\t\t\t\r\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t

\r\n\t\t\t\t\t\t\t\t\"Conservative\r\n\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\r\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t
\r\n\t\t\t\t\t\t\t

Conservative Claiming Layer<\/h3>\r\n\t\t\t\t\t\t\t

Ogni risultato \u00e8 classificato su 7 livelli, da “evidenza diretta” a “nessun supporto”. Evita gli overclaim e rende ogni affermazione tracciabile.<\/p>\t\t\t\t\t\t<\/div>\r\n\t\t\t\t\t<\/a>\r\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\r\n\t\t\t\t\t\r\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t

\r\n\t\t\t\t\t\t\t\t\"Client-Ready\r\n\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\r\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t
\r\n\t\t\t\t\t\t\t

Client-Ready Reporting<\/h3>\r\n\t\t\t\t\t\t\t

Il risultato non \u00e8 una tabella tecnica da interpretare. \u00c8 un pacchetto leggibile da R&D, management e BD: sintesi executive, grafici, dashboard interattive, priorit\u00e0, raccomandazioni e limiti metodologici espliciti.<\/p>\t\t\t\t\t\t<\/div>\r\n\t\t\t\t\t<\/a>\r\n\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\r\n\t\t<\/div>\r\n\r\n\t\n\t\t\t\t\t<\/div>\r\n\t<\/div>\r\n\r\n\t\n\n\t\t

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Vuoi conosciere di pi\u00f9? <\/strong>Contattaci o richiedi una demo dedicata!<\/p>\t\t\t\t\t<\/div>\r\n\t\t\t\t<\/div>\r\n\t\t\t\t

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\r\n\t\t\t\t\t\t\t\t\r\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\tContattaci\t\t\t\t\t\t\t\t<\/a>\r\n\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\r\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\r\n\t\t\t<\/div>\r\n\t\t<\/div>\r\n\r\n\t\n\n\r\n\t
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\r\n\t\t\t\n

La pipeline in 5 step<\/strong><\/strong><\/h2>\n<\/body><\/html>\n\n\n

Dalla molecola al report finale: flusso rigoroso e tracciabile.<\/p>\n\n\n\r\n\t

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\r\n\t\t\t\t\t\t\t1. Seed Resolution\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t<\/h3>\r\n\t\t\t\t\t<\/div> \r\n\t\t\t\t\t
\r\n\t\t\t\t\t\t

Normalizziamo la molecola da nome, SMILES, InChIKey, PubChem CID, ChEMBL ID o altri identificatori.<\/p>\t\t\t\t\t\t

\r\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\r\n\t\t\t\t\t<\/div>\r\n\t\t\t\t<\/div>\r\n\t\t\t\t\t\t\t
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\r\n\t\t\t\t\t\t\t2. Similarity Retrieval & Rescoring\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t<\/h3>\r\n\t\t\t\t\t<\/div> \r\n\t\t\t\t\t
\r\n\t\t\t\t\t\t

Recuperiamo i composti simili da fonti strutturate e li riscoriamo con sei metriche aggregate in consensus.<\/p>\t\t\t\t\t\t

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\r\n\t\t\t\t\t\t\t3. Annotation & Aggregation\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t<\/h3>\r\n\t\t\t\t\t<\/div> \r\n\t\t\t\t\t
\r\n\t\t\t\t\t\t

Integriamo target, attivit\u00e0, assay, meccanismi e metadati da database farmacologici esterni.<\/p>\t\t\t\t\t\t

\r\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\r\n\t\t\t\t\t<\/div>\r\n\t\t\t\t<\/div>\r\n\t\t\t\t\t\t\t
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\r\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t

\r\n\t\t\t\t\t\t\t4. Prioritization & Verification\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t<\/h3>\r\n\t\t\t\t\t<\/div> \r\n\t\t\t\t\t
\r\n\t\t\t\t\t\t

Classifichiamo ogni target nei 7 bucket interpretativi e verifichiamo il panel di interesse del cliente.<\/p>\t\t\t\t\t\t

\r\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\r\n\t\t\t\t\t<\/div>\r\n\t\t\t\t<\/div>\r\n\t\t\t\t\t\t\t
\r\n\t\t\t\t\t
\r\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t

\r\n\t\t\t\t\t\t\t5. Report & Deliverable\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t<\/h3>\r\n\t\t\t\t\t<\/div> \r\n\t\t\t\t\t
\r\n\t\t\t\t\t\t

Report executive, workbook Excel, CSV di audit, grafici statici, dashboard HTML interattive e raccomandazioni operative.<\/p>\t\t\t\t\t\t

\r\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\r\n\t\t\t\t\t<\/div>\r\n\t\t\t\t<\/div>\r\n\t\t\t\t\t<\/div>\r\n\t<\/div>\r\n\r\n\t\n\t\t\t\t\t<\/div>\r\n\t<\/div>\r\n\r\n\t\n\n\r\n\t
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Chi usa questo servizio<\/strong><\/strong><\/strong><\/h2>\n<\/body><\/html>\n\n
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\n\t\t\t\t\t
<\/div> \n\t\t\t\"PHARMA<\/img> \n\t\t \n\t\t
\n\t\t\t\t\t

\n\t\t\t\t\t\t\t\tPHARMA & <\/span> \n\t\t\t<\/h3> \n\t\t\t\t\t\t\t

BIOTECH<\/h4> \n\t\t\t\t\t\t
\n\t\t\t\t

<\/p>\n\t\t\t<\/div> \n\t\t\t\t\t\t\t

\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div> \n\t\t\t \n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div> \n\t\t \n\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div> \n \n \n\t<\/div>\n\n\n\n
\t \n\t
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<\/div> \n\t\t\t\"CRO\"<\/img> \n\t\t \n\t\t
\n\t\t\t\t\t

\n\t\t\t\t\t\t\t\tCRO<\/span> \n\t\t\t<\/h3> \n\t\t\t\t\t\t\t

CONTRACT RESEARCH ORGANIZATION<\/h4> \n\t\t\t\t\t\t
\n\t\t\t\t

<\/p>\n\t\t\t<\/div> \n\t\t\t\t\t\t\t

\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div> \n\t\t\t \n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div> \n\t\t \n\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div> \n \n \n\t<\/div>\n\n\n\n
\t \n\t
\n\t\t\t\t\t
<\/div> \n\t\t\t\"NUTRACEUTICA\"<\/img> \n\t\t \n\t\t
\n\t\t\t\t\t

\n\t\t\t\t\t\t\t\tNUTRACEUTICA<\/span> \n\t\t\t<\/h3> \n\t\t\t\t\t\t\t

& COSMETICA<\/h4> \n\t\t\t\t\t\t
\n\t\t\t\t

<\/p>\n\t\t\t<\/div> \n\t\t\t\t\t\t\t

\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div> \n\t\t\t \n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div> \n\t\t \n\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div> \n \n \n\t<\/div>\n\n\n\n
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<\/div> \n\t\t\t\"BC,<\/img> \n\t\t \n\t\t
\n\t\t\t\t\t

\n\t\t\t\t\t\t\t\tBC, LICENSING<\/span> \n\t\t\t<\/h3> \n\t\t\t\t\t\t\t

& QA<\/h4> \n\t\t\t\t\t\t
\n\t\t\t\t

<\/p>\n\t\t\t<\/div> \n\t\t\t\t\t\t\t

\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div> \n\t\t\t \n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div> \n\t\t \n\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div> \n \n \n\t<\/div>\n<\/div>\n<\/body><\/html>\n\t\t\t\t\t<\/div>\r\n\t<\/div>\r\n\r\n\t\n\n\r\n\t
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I vantaggi<\/strong><\/h2>\n\n\n\n

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\r\n\t\t\t\t\t\t\tApproccio Conservativo\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t<\/h3>\r\n\t\t\t\t\t<\/div> \r\n\t\t\t\t\t
\r\n\t\t\t\t\t\t

Similarit\u00e0 non significa automaticamente binding diretto. La pipeline produce claim classificati su 7 livelli, non predizioni aggressive. Il risultato \u00e8 scientificamente pi\u00f9 solido e pi\u00f9 utile nelle decisioni reali<\/p>\t\t\t\t\t\t

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\r\n\t\t\t\t\t\t\tModulare e personalizzabile\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t<\/h3>\r\n\t\t\t\t\t<\/div> \r\n\t\t\t\t\t
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Singola molecola, serie di analoghi, libreria o programma continuativo. Il cliente pu\u00f2 definire il panel, l’area terapeutica e il perimetro dell’analisi. L’output si adatta al contesto.<\/p>\t\t\t\t\t\t

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\r\n\t\t\t\t\t\t\tBundle client-read\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t<\/h3>\r\n\t\t\t\t\t<\/div> \r\n\t\t\t\t\t
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Il risultato \u00e8 un pacchetto leggibile da R&D, management e BD, con sintesi, grafici, priorit\u00e0, raccomandazioni e limiti metodologici esplicitati. Non una tabella da interpretare in autonomia. <\/p>\t\t\t\t\t\t

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\r\n\t\t\t\t\t\t\tOrientamento Rapido\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t<\/h3>\r\n\t\t\t\t\t<\/div> \r\n\t\t\t\t\t
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Kick-off in 24 ore dalla conferma dell’input. Consegna entro una settimana lavorativa. Progettato per aiutare a decidere rapidamente se investire in assay, sviluppo preclinico, IP, partnership o repositioning. <\/p>\t\t\t\t\t\t

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Possibili applicazioni<\/strong><\/strong><\/strong><\/strong><\/h2>\n<\/body><\/html>\n\n\n
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IDENTIFICAZIONE TARGET<\/strong><\/p>\n

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Identifica target biologici plausibili associati a una molecola e ricostruisce il suo profilo target-oriented.<\/p>\n\t\t\t<\/div>\r\n\t\t\t\t\t\t\t

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DRUG REPURPOSING & REPOSITIONING<\/strong><\/p>\n

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Supporta attivit\u00e0 di repurposing e repositioning con evidenze strutturate su nuove indicazioni plausibili.<\/p>\n\t\t\t<\/div>\r\n\t\t\t\t\t\t\t

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CONFRONTO TRA CANDIDATI<\/strong><\/p>\n

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Confronta molecole candidate all’interno di una stessa classe chimica e identifica differenze nel profilo biologico.<\/p>\n\t\t\t<\/div>\r\n\t\t\t\t\t\t\t

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PRIORITIZZAZIONE SPERIMENTALE<\/strong><\/p>\n

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Prioritizza gli esperimenti successivi indicando quali target hanno un razionale solido e quali sono solo ipotesi da esplorare.<\/p>\n\t\t\t<\/div>\r\n\t\t\t\t\t\t\t

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MATERIALE SCENTIFICO-COMMERCIALE<\/strong><\/p>\n

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Costruisce la base documentale per dossier, grant, partnership e business development con un razionale biologico difendibile.<\/p>\n\t\t\t<\/div>\r\n\t\t\t\t\t\t\t

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Hai un’esigenza specifica?<\/strong><\/h2>\n<\/body><\/html>\n\n\n
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La pipeline standard copre la maggior parte dei casi d’uso. Per alcuni progetti \u00e8 possibile definire un setup su misura: integrare un database interno, lavorare su una serie strutturata di analoghi, impostare un programma continuativo su un portafoglio di asset.
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Raccontaci il tuo progetto<\/strong><\/p>\n<\/div>\n\n\n\n

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